Extraire et manipuler le Système national des données de santé (SNDS) pour l'épidémiologie et la santé publique

Public visé

Toute personne intéressée par l'utilisation du SNDS, quel que soit son profil (épidémiologiste, médecin de santé publique, médecin DIM, statisticien, data manager, économiste, technicien TIM) et son lieu d'exercice (ARS, agence, établissement de santé, ORS, structure privée, université, équipe de recherche)

Compétences visées

Manipuler les données du SNDS à visée épidémiologique

Repérer les pièges dans l'extraction et la manipulation des données du SNDS

Connaître les règles en matière de sécurité de traitement de ces données

Contenu de formation

Séquence 1

Présentation de la démarche de préparation de l'extraction et de mise en place de l'étude : bases théoriques, exemples, retour d'expériences avec les participants et les formateurs

Les 4 étapes clefs pour extraire et manipuler le SNDS

La demande auprès de la CNAM : préparation de la demande d'extraction (périmètre des données), processus de sélection de la population cible, traduction technique du protocole d'étude, validation du ciblage et des statistiques descriptives
Le chargement des données dans le cadre d'une extraction physique (hors portail) dans un environnement technique et sécurisé adapté
La vérification de la complétude des données (par rapport à la demande formulée) et le contrôle qualité
Le data management : mise au format, création de tables et de variables pour préparer la phase d'analyse (bonnes pratiques)

Séquence 2

Ateliers pratiques reprenant ces quatre étapes, avec utilisation de SASGuide ou R et d'un système de gestion des bases de données (SGBD)